Men vi sinh xử lý nước thải là các chủng vi sinh vật có khả năng xử lý nước thải tốt nhất phân lập trong phòng thí nghiệm, sau khi được nhân giống ở điều kiện môi trường thích hợp sẽ được thu gom và xử lý thành dạng men vi sinh. Tuy vào từng công nghệ sản xuất chế phẩm vi sinh người ta có thể đưa nó vào môi trường khác nhau như dạng lỏng (men vi sinh dạng lỏng) hoặc dạng rắn (men vi sinh dạng bột).